3. sezonun ilk bölümünde Pete yeni ortağına alışmaya çalışırken, bir yandan da Denver'daki bir takım şüpheli ölümleri incelemektedir.

Pete ve Myka, kurbanlarının akıllarını kaybetmelerini sağlayan bir objenin peşine düşer. Steve ve Claudia ise Boston'a gider.

Artie ve Claudia, Doktor Vanessa Calder ve Hugo Miller'la birlik olup insanları oyun hamuruna çeviren bir bilgisayar virüsüyle savaşırlar.

Pete'nin eski karısı Amanda onu ziyaret edip tekrardan başka biriyle evleneceğini açıklar. Bu sırada istemeden tehlikeli güçlere sahip bir objeye dokunur ve onun etkisi altında kalır.

Pete ve Myka, 19. yüzyılda Londra'da bir objeyle mücadele eden Helena'yla iş birliği yapmak zorundadır.

Ajanlar ve Claudıa birlik olup Douglas Fargo ve başka bir oyuncuyu, sanal bir gerçekliğin etkisinden kurtarmaya çalışmaktadırlar.

Pete, Myka'ya tehlikeli bir katili yakalaması için yardım etmektedir. Artie, Claudie ve Steve de bir olaya tanık olan bir köpeği soruşturmaktadırlar.

Gizemli bir organizasyon ajanlara bir saldırı düzenler. Bir gökdelende mahsur kalan Myka ve Artie, güvenliği sağlamaya çalışırken, Pete ve Claudıa da olayın kaynağını araştırmaktadır.

Claudia ve Myka, sinirlendiği herkesi parçalara ayırma yeteneğine sahip bir kadının davasıyla ilgilenmektedirler.

Myka ve Pete, bir zombi istilasına sebep olan bir objeyi araştırmaktadırlar.

Pete ve Myka depodan çalınan ve çok gizli olan bir dosyanın peşindedir. Bu olay onları Wyomıng'deki bir liseye götürecektir.

Sykes'ın intikam planı ortaya çıkmıştır. Bu plan, ajanlardan birinin hayatına mal olacaktır.

Pete yanlışlıkla bir objeyi harekete geçirir ve kendini hiç varolmadığı bir gerçeklikte bulur. Kendi bildiği boyuta dönebilmek için arkadaşlarının yardımına ihtiyacı vardır.