Stargate'in dokuzuncu geçidini araştıran bir inceleme ekibi gizli üsleri bilinmeyen bir düşman tarafından saldırıya uğrayınca geçitten geçmek zorunda kalırlar. Sonunda kendilerini dünyadan milyarlarca ışık yılı uzakta Destiny adlı bir uzay gemisinde mahsur kalmış bulurlar.

Icarus üsüünden tahliye edilip Destiny'de mahsur kalan ekip, geminin yaşam destek sisteminin birkaç saat içinde işlemez hale geleceğini fark eder.

Üsteğmen Scott ve Dr. Rush, Destiny'nin yaşam destek sistemi için gerekli olan bir minerali bulmak için ıssız bir gezegene seyahat ederler.

Dr. Nicholas Rush, geminin güç kaynaklarının neden ciddi derecede düşük olduğunu bulmaya çalışmaktadır.

Grup, üç gezegenden birine yaklaşıyor. Coloney Young, kurayla seçilecek on beş kişinin gidebileceğini açıklıyor.

Grup, bir buz gezegeninden su temin etmek için harekete geçiyor. Young ve Scott buza ulaştığında, uzaylı yaratıklar bir askere saldırarak grubun geri kalanını tehdit ediyorlar.

Antik iletişim taşlarının yardımıyla, riskli de olsa bir planla dünyaya geri dönme ihtimali doğuyor.

Orman dünyasına giden bir ekip henüz vurmadıkları kendi görüntüleriyle karşılaşıyorlar.

Ekipten bir kaç kişi antik iletişim aracını kullanarak sevdiklerinin iyi olup olmadıklarına bakıyorlar.

Gruptan bir kişi bir suç karşısında baş şüpheli konumuna yerleşiyor. Diğerlerinin bu durumu bir karara bağlamaları gerekiyor.

İletişim taşlarının bozulması ve Young'ın bilincinin bilinmeyen bir uzay gemisine gitmesinin sonucunda grubu zorlu bir yarış bekliyor.

Destiny'deki bazı siviller, geminin kontrolünü ordu personellerini alt ederek ele geçiriyor.

Destiny, yemek ve su bolluğuna sahip bir gezegenin yanında duruyorlar ancak geri sayım saatinin çalışmadığını fark ediyorlar.

Rush, geminin bilgisayarını denerken trajik olaylar yaşadığı bir zamana geri dönüyor.

Scott, Eli ve Chloe, Stargate'e geri dönmeye çalışırken Greer, ıssız bir gezengende ölüme terkediliyor.

Destiny'de aşırı yükleme sonucu bir modül patlayınca çözüm için Dünyadan bir bilimadamının yardımını kullanıyorlar.

Uzaktaki bir ekibi parazitler itila edince Destiny grubu, korkulu rüyalarının görüntüleriyle uğraşmak zorunda kalıyorlar.

Rush, Destiny ile alakalı birinin Lucian Alliance adına ajanlık yaptığını düşünüyor.

Lucian Alliance'ın komutanı Kiva, Destiny grubundan bir kaç üyeyi rehin alıyor.

Young ve Camille, Kiva'nın rehin aldığı üyeleri kurtarmaya çalışıyorlar.